پایان نامه ارائه یک روش برای بخش بندی بطن راست و چپ از تصاویر MRI قلبی
تعداد صفحه:
۱۰۳
دسته بندی:
مهندسی برق – الکترونیک
پایان نامه کارشناسی ارشد در رشتهی مهندسی پزشکی- بیوالکتریک چکیده ارائه یک روش برای بخشبندی بطن راست و چپ از تصاویر MRI قلبی بررسی ساختار و عملکرد بطنهای قلب در تصاویر رزونانس مغناطیسی یک گام مهم در مدیریت بسیاری از اختلالات قلبی به حساب میآید. با اینکه بخشبندی دستی بطنهای قلب نتایج خوبی را حاصل می کند، اما بخشبندی دستی بطن ها خصوصا بطن راست به علت هندسه پیچیده آن کار ...
سمینار معرفی رشته مهندسی پزشکی
تعداد صفحه:
۵۶
دسته بندی:
علوم پزشکی
موضوع سمينار: معرفي رشته مهندسي پزشكي
دانشكده مهندسي پزشكي
سال 85
---
چكيده
در قرن بيستم نوآوريهاي تكنولوژي با چنان سرعتي در حال پيشرفت است كه تقريباً در هر زمين
در نمونههای این صفحه، داده پزشکی به مسئله مهندسی تبدیل میشود
سه محور روشن در فایلهای موجود دیده میشود: تصویر CT، تصویر MRI قلب و سیگنال ECG. در هر سه مورد، داده از یک زمینه پزشکی میآید اما سؤال اصلی با پردازش، استخراج اطلاعات یا طبقهبندی پاسخ داده میشود. به همین دلیل، هنگام انتخاب نمونه باید هم منبع و معنای پزشکی داده را فهمید و هم زنجیره محاسباتی را بررسی کرد.
نام الگوریتم بهتنهایی معیار مناسبی برای شباهت دو پژوهش نیست. یک روش ممکن است در CT برای کاهش یا جداسازی اثر فلز استفاده شود و همان خانواده روش در مسئلهای دیگر هدف کاملاً متفاوتی داشته باشد. نوع داده، هدف خروجی و شیوه ارزیابی باید با موضوع شما همخوان باشند.
در CT، مسئله پروتز و ایمپلنت از مرحله تشکیل تصویر شروع میشود
وجود فلز در تصویربرداری CT میتواند روی اندازهگیری و بازسازی تصویر اثر بگذارد. نمونه مربوط به جداسازی تصویر پروتز یا ایمپلنت از سینوگرام، مسئله را پیش از خروجی نهایی تصویر دنبال میکند و از کانتور فعال برای تشخیص ناحیه مرتبط استفاده میکند. برای استفاده از چنین نمونهای باید بدانید ورودی الگوریتم چیست و خروجی آن در کدام مرحله از فرایند بازسازی استفاده میشود.
همچنین لازم است معیار موفقیت مشخص باشد. آیا روش ناحیه فلزی را دقیقتر جدا میکند؟ آیا آرتیفکت تصویر کاهش مییابد؟ آیا نتیجه روی داده شبیهسازیشده، فانتوم یا داده واقعی ارزیابی شده است؟ پاسخ به این پرسشها اهمیت بیشتری از شباهت نام الگوریتم دارد.
در MRI قلب، قطعهبندی باید با مرجع معتبر سنجیده شود
نمونه قطعهبندی بطن راست و چپ قلب با تصاویر MRI روی استخراج مرز یا ناحیه ساختاری از تصویر تمرکز دارد. در این نوع پژوهش، پیشپردازش، انتخاب فریم یا برش، تفاوت شدت تصویر و حرکت قلب میتوانند بر نتیجه اثر بگذارند. روش باید در برابر این تغییرات ارزیابی شود.
یک مرز تصویری فقط زمانی ارزش مهندسی دارد که با مرجع قابل اعتماد مقایسه شود. برچسب متخصص، داده مرجع یا روش پذیرفتهشده میتواند نقش Ground Truth را داشته باشد. معیارهایی مانند همپوشانی ناحیه، فاصله مرز، حساسیت یا خطای اندازهگیری باید متناسب با هدف انتخاب شوند. اگر پایاننامه فقط چند تصویر نمونه نشان میدهد و ارزیابی کمی کافی ندارد، برای استنتاج عملکرد روش محدودیت دارد.
در ECG، پردازش قبل از طبقهبندی شروع میشود
نمونه طبقهبندی ECG با SVM و PSO نشان میدهد که مدل طبقهبندی آخرین بخش یک زنجیره است. حذف نویز، تشخیص ضربان، قطعهبندی، استخراج ویژگی و انتخاب ویژگی میتوانند نتیجه نهایی را تغییر دهند. اگر دو پژوهش از SVM استفاده کنند اما ورودی و ویژگیهای متفاوت داشته باشند، مقایسه مستقیم دقت آنها منطقی نیست.
در این نمونه، روش بهینهسازی نیز باید نقش مشخصی داشته باشد؛ مثلاً تنظیم پارامتر یا انتخاب مجموعه ویژگی. استفاده از نام یک الگوریتم فراابتکاری بدون توضیح اینکه چه چیزی را بهینه میکند، شباهت پژوهشی ایجاد نمیکند. برای موضوع جدید، هر مرحله را همراه با دلیل و معیار ارزیابی آن بنویسید.
تقسیم داده در پژوهش پزشکی بخشی از اعتبار نتیجه است
در دادههای پزشکی، نمونههای یک بیمار ممکن است بسیار به هم شبیه باشند. اگر بخشی از داده یک فرد در آموزش و بخش دیگر همان فرد در آزمون قرار گیرد، مدل میتواند عملکردی بیش از توان واقعی خود نشان دهد. به همین دلیل بهتر است تقسیم آموزش، اعتبارسنجی و آزمون در سطح بیمار و با توجه به ساختار داده انجام شود.
عدم تعادل کلاسها نیز مهم است. در بسیاری از مسائل تشخیصی، تعداد نمونه سالم و بیمار برابر نیست. گزارش صرف «دقت کلی» میتواند گمراهکننده باشد. حساسیت، ویژگی، precision، recall، AUC یا معیارهای متناسب با مسئله باید در کنار ساختار داده دیده شوند.
مرز مهندسی پزشکی با پزشکی و هوش مصنوعی از سؤال اصلی مشخص میشود
پزشکیبودن داده به این معنی نیست که هر پژوهش بالینی یک مسئله مهندسی پزشکی است. اگر سؤال درباره درمان، شیوع، پیامد بالینی یا مراقبت بیمار باشد، پایاننامههای علوم پزشکی زمینه نزدیکتری دارند. در مقابل، اگر سؤال درباره اندازهگیری، بازسازی، پردازش، مدلسازی یا طراحی سامانه روی داده پزشکی است، منطق مهندسی پررنگتر میشود.
همچنین استفاده از SVM، PSO یا شبکه عصبی بهتنهایی پژوهش را به موضوع عمومی هوش مصنوعی تبدیل نمیکند. داده، محدودیتهای پزشکی و معیار کاربردی باید در مرکز سؤال باقی بمانند. الگوریتم ابزار پاسخدادن به مسئله است.
پیش از دانلود چه مشخصاتی را از هر فایل استخراج کنیم؟
نوع داده و دستگاه، تعداد بیمار یا نمونه، نحوه برچسبگذاری، پیشپردازش، ویژگیها، الگوریتم، روش تقسیم داده و معیار ارزیابی را در یک جدول کوتاه بنویسید. برای تصویر پزشکی، وضوح و پروتکل تصویربرداری نیز مهم است؛ برای سیگنال، نرخ نمونهبرداری، طول قطعه و فیلترها را کنترل کنید.
فناوری تصویربرداری، مجموعهدادهها و روشهای پردازش سریع تغییر میکنند. پایاننامه قدیمی برای شناخت صورتبندی مسئله و مسیر آزمایش مفید است، اما برای پروژه جدید باید منابع علمی، استانداردهای گزارش و روشهای ارزیابی روز دوباره بررسی شوند.